Taşdöğen, S., Parlak, İ.B., Akın, A., Ülgen, K.Ö., “Migren Hastalarında Entegre Nörovasküler Eşleşme Modeli”, Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı Bildiriler Kitabı BİYOMUT’07, Boğaziçi Üniversitesi Yayınları, İstanbul, 2007. Dil Türkçe
Durmuş, S., Arga, K.Y., Ülgen, K.Ö., “Drug Targets for Tumorigenesis: Insights from Structural Analysis of EGFR Signaling Network”, Journal of Biomedical Informatics, 30, 327-338, 2008. Dil Türkçe
Altıntaş, M.M., Ülgen, K.Ö., Palmer-Toy, D., Vivian, E., Shih, V.E., Kompala, D.S., Reiser, J., “Emerging Roles for Metabolic Engineering - Understanding Primitive and Complex Metabolic Models and Their Relevance to Healthy and Diseased Kidney Podocytes”, Current Chemical Biology, 2, 1, 68-82, 2008. Dil Türkçe